در سال ۱۲۷۹شمسی همزمان با حکومت مظفرالدین شاه مستشاران بلژیکی برای اصلاح وضعیت گمرکات ایران وافزایش عواید گمرکی به استخدام دولت ایران درآمدندووگمرک زاهدان تاسیس گردید وبرای اصلاح اوضاع مالیه وگمرکات ایران به اقدامات خوبی دست زدند ودر فاصله سالیان ۱۲۷۹تا۱۳۰۰هجری شمسی اداره مستقلی تحت عنوان مالیه (دارایی) در دزداب وجود نداشت و در واقع مالیه وگمرکات دزداب به وسیله تشکیلات واحدی اداره می شد. حدودا در سال ۱۳۰۰هجری شمسی وپس از پایان جنگ جهانی اول همزمان با تاسیس حکومت دزداب ظاهرا اداره مالیه دزداب از اداره گمرک جداشد وبه طور مستقل به فعالیت پرداخت از تاریخ دقیق تاسیس اداره مالیه دزداب اطلاعی در دست نیست اما وجود اداره مالیه در سال ۱۳۰۴هجری شمسی به ریاست اسماعیل تفرشی مسجل می باشدواداره مزبور که اداره مالیه ایالتی دزداب هم خوانده میشد زیر نظر اداره مالیه ایالتی سیستان قرار داشت وبه لحاظ اداری بخشی از تشکیلات مالیه ایالتی خراسان و سیستان به شمار می رفت ورییس مالیه خراسان وسیستان پیشکار نامیده می شد به عنوان مثال در سال ۱۳۰۷که میرزا رضا خان افشاری به عنوان متصدی بلدیه دزداب به این شهر آمد برای برقرای حقوق خویش با اداره مالیه دزداب مکاتبه نمود، اداره مالیه دزداب به گواهی اسناد درخواست وی را به اداره مالیه سیستان منعکس نمود وپاسخ مالیه سیستان را به شرح زیر به میرزا رضا خان نوشت:
آقای میرزا رضا خان :متصدی بلدیه دزداب
با ارسال سواد تلگراف اداره جلیله مالیه ایالتی سیستان اشعار میدارد تاوصول حکم انتصاب شما از وزارت جلیله مالیه دامت شوکه – این اداره از پرداخت حقوق شما خودداری خواهد نمود لازم است حقوقات دی وبهمن را که دریافت داشته اید مسترد نموده، قبض رسید دریافت دارید. (رییس مالیه دزداب، امضاء)
درسال ۱۳۰۹دزداب به زاهدان تغییر نام یافته ودر سال ۱۳۱۰ پس از تصویب قانون جدید تقسیمات کشوری با جدایی سیستان از خراسان وبلوچستان از کرمان استان سیستان وبلوچستان پدید آمد وزاهدان به مرکزیت آن برگزیده شد ودر سال ۱۳۱۳ علی اکبرداور وزیردارایی وقت برای بررسی اوضاع مالی به اداره مالیه زاهدان آمد و در سال ۱۳۱۵اداره مالیه مستقل گشته و به اداره دارایی مالی زاهدان تغییر نام یافت وعهده دار فعالیتهایی همچون امور مالی ومالیاتی، دخانیات، قندوشکر، چای، غله وبعضی امور دیگر بوده است با توجه به بررسیهای اجمالی اطلاعات دقیقی از کلیه روسای دارایی زاهدان ازبدو تاسیس موجود نیست واز جمله روسا میتوان به آقایان شهیدی(۱۳۱۴)، احدزاده(۱۳۲۰)، لاچینی(۱۳۲۶)، قائم مقامی(۱۳۲۷)اشاره کرد. پس از پیروزی انقلاب اسلامی نیز آقایان فرج زاده(۱۳۵۸)، دیزجی(۱۳۵۹)، باانصاف(۱۲۶۲)، پیروزان(۱۳۶۶)، قدسی زاده(۱۳۶۷)، حسینی(۱۳۷۰)، شهیدی(۱۳۷۳)، نمک شناس (۱۳۸۱)، علی ابراهیمی (۱۳۸۴)، رضا اصغری (۱۳۹۰)، مهدی خیاطی (۱۳۹۵) , امیر مرتضوی (1396) و و از تاریخ 1400/10/12نیز آقای عباسعلی رضائی عهده دار ریاست سازمان می باشند.