تحقیق و توسعه، محور اصلی ساختار نظام اداری کشور و توسعه پایدار و متوازن است. در ماده (64) قانون برنامه ششم توسعه و آیین‌نامه‌های اجرایی ذی‌ربط، ماده (56) قانون الحاق برخی مواد به قانون تنظیم بخشی از مقررات مالی دولت و ... بر کارآمدکردن نظام تحقیق و توسعه برای تبدیل ایده‌ها به محصولات یا خدمات و استفاده از نتایج فعالیت‌های پژوهشی تأکید شده است. در این راستا، امور پژوهشی معاونت امور اقتصادی با هدف تولید علم و گسترش مرزهای دانش در سطح ملی، ارتقای جایگاه پژوهش و تحقیق در معاونت‌ امور اقتصادی، کاربردی‌کردن دانش در سیاست‌گذاری‌ها و تصمیم‌سازی‌های اقتصادی و تحقق اهداف این معاونت در راستای سند چشم‌انداز ۲۰ ساله جمهوری اسلامی ایران، اقدامات متعددی به‌شرخ ذیل را در دستور کار خود قرار داده است:

1. عضویت در کمیسیون‌های و کارگروه‌های تخصصی مرتبط با علم و فناوری؛
2.  انجام امور مربوط به کمیسیون‌های تخصصی مرتبط با علم و فناوری؛
3.  تدوین و اصلاح قوانین و مقررات مرتبط با علم و فناوری؛
4. تدوین چارچوب سیاست‌گذاری‌های پژوهشی سالانه شورای پژوهشی و پیشنهاد به شورا جهت تصویب؛
5.  طراحی و استقرار نظام ارزیابی راهبردی و تنظیم و تدوین شاخص‌های ارزیابی فعالیت‌های پژوهشی؛
6.  نیازسنجی پژوهش‌های مرتبط با حوزه عملکرد وزارت؛
7. نیازسنجی اولویت‌های تحقیقاتی حمایت از پایان‌نامه‌های تحصیلات تکمیلی مرتبط با حوزه عملکرد وزارت؛
8.  ایجاد ارتباط و انجام همکاری‌های مشترک با واحدهای پژوهشی کشور (اندیشکده‌ها، گروه‌های پژوهشی و ...)؛
9.  انتشار کتب معاونت امور اقتصادی؛
10.  انتشار نشریات علمی-تخصصی (فصلنامه پژوهش‌ها و سیاست‌های اقتصادی، فصلنامه سیاست‌های مالی و اقتصادی، مجله اقتصادی)؛
11.  انجام امور مربوط به انعقاد قراردادهای پژوهشی-تحقیقاتی؛
12.  اعلام محورها و زیرمحورهای پژوهشی و اولویت‌های تحقیقاتی حمایت از پایان‌نامه‌های تحصیلات تکمیلی در سامانه ساتع وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، دانشگاه‌ها و ... .
13.  اطلاع‌رسانی محورها و زیرمحورهای پژوهشی، اولویت‌های تحقیقاتی حمایت از پایان‌نامه‌های تحصیلات تکمیلی، شناسنامه و همچنین نتایج طرح‌های تحقیقاتی و پایان‌نامه‌های مصوب شورای پژوهشی و خاتمه‌یافته در سایت معاونت؛
14.  نظارت بر مراحل و چگونگی انجام طرح‌های پژوهشی و پایان‌نامه‌های تحصیلات تکمیلی؛
15.  نشر و ترویج نتایج حاصل از تحقیقات انجام‌شده؛
16.  تدوین گزارش‌های سیاست‌گذاری مستخرج از طرح‌های پژوهشی انجام‌شده و مقالات منتشرشده؛
17.  نظارت بر حسن اجرای مصوبات شورای پژوهشی؛
18. برنامه‌ریزی، تنظیم فعالیت‌ها و پیشنهاد بودجه پژوهشی سالیانه معاونت ذی‌ربط بر اساس اولویت‌های تعیین‌شده؛
19.  شناسایی و تعریف موضوعات و برنامه‌های علمی پژوهشی مشترک و برنامه‌ریزی جهت تعامل با حوزه تخصصی دانشگاه‌ها و دستگاه‌های مختلف؛
20. تهیه گزارش سالانه، بر اساس ارزشیابی پیشرفت و کیفیت فعالیت‌های پژوهشی؛
21. جمع‌آوری و تجمیع گزارش‌های عملکرد پژوهشی سالانه وزارت، جهت ارائه در جلسات شورای پژوهشی؛
22. انجام بررسی‌ها و مطالعات لازم جهت تهیه و پیشنهاد سیاست‌های آموزشی جهت ارتقا و به‌روزسانی سطح دانش در معاونت ذی‌ربط؛
23. تدوین برنامه‌های کوتاه‌مدت، میان‌مدت و بلندمدت آموزشی با همکاری کلیه دانشکده‌ها، مراکز و واحدهای پژوهشی ذی‌ربط؛
24.  احصای اولویت‌های آموزشی و شغلی-تخصصی سالانه معاونت متبوع؛
25.  انجام امور مربوط به شرکت همکاران محترم معاونت امور اقتصادی در دوره‌های آموزشی خارج از کشور؛
26.  برگزاری نشست‌های تخصصی انتقال محتوای دوره‌های آموزشی خارج از کشور؛
27.  اعلام طرح‌های پژوهشی در سامانه سمات شورای عالی علوم، تحقیقات و فناوری؛
28.  اطلاع‌رسانی در حوزه امور پژوهشی؛
29.  انجام راهنمایی‌ها و مشاوره‌های لازم درخصوص فعالیت‌های تحقیقاتی وزارت؛
30.  راهبری سایت معاونت امور اقتصادی.